Так, во-первых пошлины у нас устанавливаются только родным государством и все прописаны в законе "О налогах и пошлинах". Во-вторых, все эти ваши затраты должны быть закреплены в договоре, иначе выплаты вообще являются малообоснованными. В-третьих оплата нерезиденту за использование лого - это плата нерезиденту за использование интеллектуальной собственности (а использование каких-то там методов - так вообще на упрвленческие и консультационные услуги тянет) и с этих сумм необходимо удержать ПНП - ставки указаны в статье 3 часть 4 - в момент выплаты (или придется восстановить в декларации по ПНП), ну разве что по конвенции вам что-нибудь скостят. А вот с ПВН, похоже, ничего страшного не будет, местом оказания всех этих услуг считается юридический адрес их получателя, т.е. Латвия - так что показываете с двух сторон в декларации - и все дела