Эти дни можно исключить из расчета периода, за который выплачивается компенсация. Только надо все документально оформить: истребовать от работника объяснительную, издать соответствующее распоряжение руководителя.

А вот я в этом не уверен, честно говоря. Во-первых, право на отпуск возникает в силу существования трдовых отношений, а не факта выхода на работу (отсюда, кстати, всяческие изыски с суммированным временем). Во-вторых, как я понимаю, сие безобразие продолжается уже некоторое время, однако, судя по тому, что работник до сих пор не уволен (и ещё месяц собираются его держать), руководство его работа вполне устраивает (или оно не в состоянии найти лучшую кандидатуру). В любом случае, не вижу никаких причин для того, чтобы "урезать" право данного работника на отпуск, да ив ЗоТ, насколько я помню, нет такого дисциплинарного наказания, как сокращение отпуска.

Зато есть ст.152 - когда работних не выполнял работу ПО ОБОСНОВАННЫМ причинам?