По-моему эту фразу пишут, чтобы подчеркнуть, что НДС отчисляется по оплате, а если по счёту, то не пишут.

Тоесть если мы отчисляем ПВН при поступлении, то не надо указывать в платеже эту сумму? Почему тогда разногласия у проверяющих по тематической? На каком основании мне можно обосновать, что я могу не указывать её в платёже?

Это пусть они доказывают, что вы должны показывать. Когда-то давно, когда предналог вычитался по оплате, надо было указывать в платежке НДС. Об этом в правилах КМ было написано.

А сейчас платежка никакого отношения к НДС не имеет. И зачем туда писать то, о чем не спрашивают.

На том, что у вас есть другой документ, на основании которого вы отчисляете НДС - счет. В законе убрали фразу о том, что в платежке надо указывать НДС.

С 01.01.2005 главным действующим игроком на поле ПВН является налоговый счет ( в котором указывается и сумма сделки и сумма ПВН) и, если указывать № счета, дату и сумму, то и счет будет приложен, а платежное поручение в постоянных расчетах с партнерами (используя электронные услуги банка)уже становиться пережитком. Да и от руки заполняется так-же.